2012'de UEFA Avrupa Ligi C Grubu'nda Fenerbahçe -Marsilya maçının 6. dakikasında Gökhan Gönül'ün vuruşunda Fransız ekibinin kalecisi Mandanda topu son anda çıkardı. Sarı-lacivertli futbolcular hakeme gol itirazında bulundu ancak hakem Ivan Bebek, yardımcılarından da aldığı uyarı ile golü vermedi.
2015'in Ağustos ayında oynanan UEFA Avrupa Ligi eleme maçında Fenerbahçe ile Atromitos karşılaşmış maçı Ivan Bebek yönetmişti. Bebek bu maçta da ceza sahası dışında topla elle oynayan Atromitos kalecisine kırmızı kart göstermemişti.
